Бранхиомикоз — опасное микозное заболевания рыб разных видов и возрастов, возникающее в прудовых, сад¬ковых рыбоводных хозяйствах и естественных водоемах, особенно в озерах. Оно может вызывать массовую гибель рыбы. Возбудителями у карпа, карася и пескаря является гриб Branchipmices sangvuinis, у щуки –B.demigrans. Мицелий гриба состоит из древовидно-разветвленных гиф  с толстой оболочкой имеющей вид двойной контурированной мембраны толщиной 0,5-0,7 мкм.
Болезнь возникает в хозяйствах, где слагаются благоприятные условия для развития возбудителя(высокое содержание органических веществ, низкое содержание О2, большие иловые отложения т др). Болезнь протекает в форме эпизоотии. Заражение рыб происходит через инфицированное ложе пруда.  Симптомы: Отдельные участки жаберной ткани отмирают, и у жабр возникает неровные края. Больные рыбы не берут корм, не реагируют на внешние раздражители, всплывают в верхние слои воды, но не заглатывают воздух как при заморе. Гибель сеголетков и двухлеток рыб достигает 50-70 %. У выживших рыб болезнь принимает подострое  и хроническое течение, жабры становятся будто изъеденными.
В результате разрастания гриба внутри кровеносных сосудов происходит закупорка, которая сопровождается расстройством кровообращения и образованием застоя крови, затем дальнейшим некрозом жаберной ткани и ее пестро-мозаичной окраской.
Диагностика: Диагноз ставят на основании эпизоотологических данных, клиники и микроскопического исследования жаберной ткани. 
Лечение: Для лечения применяют медный купорос(0,25 мг/л) в сочетании с перманганатом калия(0,1 мг/л). Медный купорос необходимо вносить в первую очередь, так как он является катализатором перманганата калия. Препарат в 1%-ной концентрации разбрызгивается машиной ДУК по акватории пруда с прекращением водоема на 24 ч. При необходимости курс лечения повторяют.
В целях профилактики бранхиомикоза рекомендуют повысить водообмен в прудах, а при вспышки болезни давать медный купорос(0,25 мг/л) в сочетании с перманганатом калия 0.1 мг/л или каждый день вносить негашеную известь из расчета 150-200 кг\га до прекращения отхода рыб.